当研究人员用SAPS对之前已经在乳腺及卵巢中鉴定到的预后特征进行分析时发现,只有少数的特征经SAPS评估后仍具有统计学意义.“我们的工作表明,当使用预后关联来鉴定癌症发展的生物特征时,不能单单依赖于那些只与病人生存有关的基因集.”Beck说.“一个基因集与生存的相关性似乎十分重要,但事实上,它的表现并没有明显优于随机基因.这是一个严重的问题,因为这可以导致错误结论的产生.”Beck及其同事通过SAPS,发现他们可以克服这一困难.“SAPS程序可以确保一个重要的预后基因集不仅与患者存活期有关联,而且所起的作用要显著优于随机基因的.”Beck说.他的研究小组在乳腺癌及卵巢癌亚型中发现了新的预后特征,而且证明了雌激素受体阴性乳腺癌与卵巢癌两者的预后特征具有惊人的相似性,暗示着这些恶性肿瘤拥有相同的治疗靶标.
 

          这些发现同样暗示着SAPS所鉴定到的预后特征不仅能帮助病人预测病情发展,还有助于新抗癌药物的开发.“希望我们所鉴定到的标记能帮助我们更深入地了解乳腺癌及卵巢癌亚型癌症发展的生物通路,将来有一天可以帮助我们改良有针对性的诊断及治疗方法.”Beck说,“我们希望这个方法能为其他研究人员提供广泛的应用价值.”为了实现这一目的,研究小组创建了一个网络访问工具,让那些对统计软件及程序不太熟悉的研究人员能在其它疾病中鉴定到与疾病发展相关的基因集.“我们还计划不久后就释放这个软件包,里面包含了所有的代码及与分析相关的文档.”Haibe-Kains补充说,“这样,其他人就可以重复我们的结果,从而使生物信息学及计算生物学团体能够对我们的分析方法进行接收及改良,以此来解决生物医学上所遇到的新问题.”