在干细胞分化及X-染色体失活（使一个雌性X-染色体沉默、以确保两性之间基因剂量对等的过程）期间，染色质发生表观遗传重新编程而锁定在一个新状态。 将分化的细胞重新编程为“iPS细胞”还会使失活的X-染色体被重新激活，而且曾有人提出，多能因子Oct4着这两个过程。

             在这项研究中，Donohue等人发现，Oct4通过触发X染色体配对和计数来调控X-染色体失活。Oct4与非编码RNA（Tsix 和 Xite）和蛋白（Ctcf 和Yy1）都发生相互作用。这项工作表明，干细胞中的X-染色体的表观遗传重新编程涉及一个复杂的网络。